Контролем и инспектированием деятельности таможенных органов, обеспечением ведения организационно-структурной работы в таможенных органах и организациях, контролем деятельности отдела организации и несения оперативно-дежурной службы ФТС России, РТУ, организацией силового обеспечения, организацией планирования деятельности таможенных органов и организационным обеспечением деятельности коллегии ФТС России занимается Главное организационно-инспекторское управление.
Основные направления деятельности ГОИУ:
- инспектирование деятельности таможенных органов Российской Федерации по вопросам соблюдения права ЕАЭС, законодательства Российской Федерации о таможенном деле и иного законодательства Российской Федерации при выполнении ими основных функций;
- организация и проведение по поручению руководителя ФТС России служебных проверок в структурных подразделениях ФТС России, таможенных органах (в том числе специализированных), учреждениях, находящихся в ведении ФТС России (учреждения ФТС России);
- методическое руководство, организация и контроль деятельности организационно-инспекторских подразделений региональных таможенных управлений (РТУ) и организационно-аналитических подразделений таможен;
- контроль исполнения поручений, данных по результатам инспекторских, функциональных и служебных проверок, проведенных ГОИУ;
- обеспечение ведения организационно-структурной работы в таможенных органах и учреждениях ФТС России;
- организация ежегодного планирования деятельности ФТС России, контроль и координация работы по планированию деятельности таможенных органов;
- организация и обеспечение деятельности коллегии ФТС России;
- контроль исполнения поручений руководителя ФТС России;
- организация и координация деятельности структурных подразделений ФТС России по формированию показателей результативности деятельности, показателей эффективности деятельности и индикативных показателей РТУ и таможен, непосредственно подчиненных ФТС России, и оценке выполнения показателей результативности деятельности и эффективности деятельности;
- организация и несение оперативно-дежурной службы в ФТС России.