Становление фармакогенетики как науки популяционная стратификация

Середина 20-го века ознаменовалась окончанием предварительного (эмпирического) и началом нового этапа в развитии фармакогенетики — в этот период она была признана самостоятельной научной дисциплиной.

В 1957 году A. Motulsky обобщил все доступные на тот момент данные проведённых генетических исследований лекарственных препаратов, в 1959 году F. Vogel ввёл термин «фармакогенетика». Наконец, в 1962 году W. Kalow была опубликована первая книга по фармакогенетике, а в 1967 в Нью-йорке состоялась первая конференция, посвящённая этой области науки. Именно с того времени фармакогенетические исследования стали проводиться намного активнее.

Наиболее существенной вехой в изучении фармакогенетических показателей при лечении психических расстройств стало открытие полиморфизма гена фермента цитохрома P450, а именно 2D6 — CYP2D6, метаболизирующего, как известно, большинство психотропных препаратов.

Влияние отмеченного полиморфизма на активность фермента было открыто независимо двумя учёными в конце 70-х годов прошлого века. Не будет преувеличением признать, что CYP2D6 — является к настоящему времени наиболее изученным ферментом с точки зрения фармакогенетики, поскольку обнаружено его участие в метаболизме препаратов самых различных классов.

В частности, влияние генетически детерминированного типа метаболизма CYP2D6 на фармакокинетику психотропных препаратов активно изучалось с 80-х годов (хотя имеются и более ранние публикации по фармакогенетике в психиатрии).

Так, одними из первых были опубликованы исследования галоперидола, имипрамина, клозапина. поскольку, как уже было сказано выше, фермент CYP2D6 задействован в метаболизме большинства антипсихотиков, антидепрессантов и некоторых других групп психотропных препаратов, то закономерно, что полиморфизмы гена CYP2D6 занимали и занимают важное место в психиатрических фармакогенетических исследованиях.

Популяционная стратификация

При GWAS вопрос о популяционной стратификации (неоднородном составе популяций) возникает, если в основе возникновения популяции лежало интенсивное смешивание нескольких различных родовых популяций с различными превалирующими чертами (характеристиками) и различной популяционной частотой распределения SNP.

Широко используется подход для оценки наличия популяционной стратификации, основанный на вычислении λ (λGC) геномного контроля, которая определяется как медиана χ2 (с одной степенью свободы) ассоциативного статистического пересечения SNPs, разделённая на теоретическую медиану в случае недействительного распределения.

Значения λGC~1 отражают отсутствие стратификации, тогда как λGC>1, говорят о стратификации или других популяционных аномалиях, таких как нетрадиционная структура семей, близкородственные связи или другие отклонения. Для коррекции стратификации используются некоторые методы, по которым делают вывод о генетическом происхождении, такие как главный компонентный анализ или структурная ассоциация.

Узнай цену консультации

"Да забей ты на эти дипломы и экзамены!” (дворник Кузьмич)