Полногеномные ассоциативные исследования GWAS

В эпоху развития полногеномных ассоциативных исследований (GWAS) может быть найдено большое количество локусов, ответственных за предрасположенность к БАР, с помощью высоко пропускной технологии генотипирования. Большинство проведённых GWAS на сегодняшний день были сосредоточены на определении риска развития, и лишь незначительная часть исследований посвящена поиску генетических предикторов лекарственного ответа на терапию солями лития.

Как было выявлено, участок на хромосоме 10p15 (р=5,5х10–7), а также ещё 5 полиморфизмов связаны с положительным лекарственным ответом (р<0,05), среди которых был отмечен участок хромосомы 4q32, содержащий ген глутаматного ионотропного рецептора (АМРА) GRIA2. Таким образом, полученные данные добавляют свидетельства по поводу влияния солей лития на глутаматергическую нейротрансмиссию.

В 2011 году A. Squassina et al. было проведено GWAS-исследование лекарственного ответа на литий среди биполярных пациентов Сардинии и его фенотипической оценки с использованием ретроспективных критериев по шкале долгосрочного ответа на терапию. Результатом явились данные о зависимости ответа от полиморфизма rs11869731 гена натриевых ионных каналов (ACCN1).

Полученные результаты показывают, что ген ACCN1 является потенциальным геномандидатом, который может служить генетическим маркёром эффективности терапии литием.

Относительно недавно проведённое исследование тайваньских учёных, включающее 294 пациентов c БАР, получающих литий, продемонстрировало значимую связь выраженности лекарственного ответа с геном глутамат-декарбоксилазы-подобного белка 1 (GADL1).

Глутамат-декарбоксилаза катализирует декарбоксилирование глутамата в ГАМК, тем самым являясь важным компонентом как глутаматергической, так и ГАМК-ергической нейротрансмиссии.

По инициативе International Group for the Study of Lithium-Treated Patient и Unit on the Genetic Basis of Mood and Anxiety Disorders (National Institute of Mental Health) был сформирован консорциум по генетике лития (ConLiGen), целью которого является накопление большой выборки пациентов на терапии литием для проведения полногеномных исследований ассоциаций.

Размер анализируемых данных

Маленькая выборка анализируемых данных может как приводить к ложным результатам, так и скрывать возможные достоверные отличия.

Тысячи GWAS исследований публикуются различными научными группами в течение года.