Понятие генетического полиморфизма

Наиболее точное определение генетического полиморфизма приводит в своей книге В. С. Баранов, определяя генетический полиморфизм как «генетическую изменчивость, ограниченную одним видом (Homosapiens в нашем случае)».

Генетический полиморфизм может быть качественным, когда происходят замены нуклеотидов, либо количественным, когда в ДНк варьирует число нуклеотидных повторов различной протяженности. тот и другой виды генетического полиморфизма встречаются как в смысловых (белок-кодирующих), так и во внегенных последовательностях молекулы ДНК.

В основе большинства генетических изменений, приводящих к изменению функциональности гена, лежат точечные нуклеотидные изменения в ДНК— однонуклеотидные полиморфизмы или «снипы» (от англ. SNP — single nucleotide polymorphism).

Однонуклеотидный полиморфизм (ОНП) является наиболее востребованным типом генетических вариаций, анализ которых представляет существенный практический интерес. по сравнению с другими типами вариабельности, такими как микросателлитные повторы, делеции или инсерции, точечные нуклеотидные замены наиболее широко представлены в геноме. при этом, несмотря на минимальное изменение структуры ДНК, они могут приводить к существенным изменениям свойств кодируемых генами пептидов.

Было показано, что нуклеотидные полиморфизмы влияют не только на фенотип, но и на устойчивость организмов к различным заболеваниям и внешним воздействиям, на скорость синтеза и распада различных веществ в организме, действие фармпрепаратов. Сейчас известно более 187 миллионов полиморфизмов генома человека (согласно dbSNP — базы данных по нуклеотидным полиморфизмам). Те полиморфизмы, каждая из аллелей которых встречается более.

Минимальность структурных изменений, которую обусловливают нуклеотидные полиморфизмы, диктует необходимость использования особо точных методов, которые позволяют регистрировать такие изменения. С другой стороны, информативность такого (базирующегося на ОНП) анализа будет высока только при использовании высокопроизводительных технологий анализа, позволяющих анализировать в приемлемый срок тысячи полиморфизмов.

На сегодняшний день широко используются несколько подходов, которые в зависимости от поставленной задачи позволяют точно осуществить генетический анализ. Это и традиционно использующийся метод анализа длин рестрикционных фрагментов (ПЦР-ПДРФ), минисеквенирование ДНК. А также более современные и высокопроизводительные подходы, такие как масс-спектрометрическое минисеквенирование, полногеномное секвенирование, секвенирование экзомов и генотипирование на высокоплотных чипах.