Теоретический и методический аппарат качественного и количественного анализа системных процессов, лежащих в основе формирования и реализации индивидуального опыта в норме и его реорганизации в условиях патологии, позволяет объединить в рамках системной психофизиологии исследования самого разного уровня:
- от клеточных и субклеточных механизмов формирования новых системных специализаций и межсистемных отношений;
- отражения истории обучения и межвидовых различий в системной организации активности нейронов;
- характеристик нейронных механизмов модификации и использования предсуществующих элементов опыта в рамках вновь формируемых потребностей до системной организации высокои низкоэффективной операторской деятельности и динамики её усовершенствования;
- закономерностей формирования и реализации индивидуального опыта в деятельности, предполагающей субъектно-субъектные отношения;
- особенностей структуры индивидуального опыта, опосредующей валидные формы отчётной деятельности испытуемых.
К актуальным для дальнейшего развития системной психофизиологии направлениям исследований, кроме уже упоминавшихся в этом и предыдущем параграфах, также можно отнести исследования генетической детерминации системной специализации нейронов, системных закономерностей категориального обучения, социальных детерминант структуры индивидуального опыта и др.